تتميز الفطريات بان اغلب اجزائها لديها القدرة على النمو والتكاثر , حيث يلاحظ ان تلقيح أي بيئة مناسبة بجزء بسيط من الخيوط الفطرية لاي فطر يكفي لتكوين مستعمرة فطرية جديدة.
وتتكاثر الفطريات في الطبيعة بطرق عديدة منها التكاثر اللاجنسي Asexual (بواسطة الانقسام البسيط , والتبرعم , والجراثيم اللاجنسية ) , وقد تتكاثر جنسيا sexual عن طريق الاندماج الخلوي لنواتين من خلايا ابوية Parent cells وتكوين جراثيم جنسية .
وهناك انواع من الجراثيم اللاجنسية تكونها الفطريات تشمل :
1. الجراثيم الكونيدية Conidiospores :
ويطلق عليها اسم الكونيديات Conidia ومفردها Conidium, وتتكون هذه الجراثيم في اطراف الخيوط الفطرية او على جوانبها , ومنها الصغير وحيد الخلية او كبير الحجم عديد الخلايا .
2. الجراثيم الاسبورانجية Sporangiospores :
وهي جراثيم صغيرة وحيدة الخلية توجد داخل اكياس تسمى اكياسا اسبورانجية تتكون في نهاية خيوط فطرية خاصة تنمو لاعلى بصورة عمودية , وتسمى الحوامل الاسبورانجية , وقد يكون بعض هذه الجراثيم متحركا بواسطة اسواط صغيرة Zoospore , والبعض الاخر ساكنا غير متحرك Aplanospores .
3. الاويدات Oidia :
ومفردها اوديم Oidium , وتسمى الجراثيم المفصلية Arthrospores وتكونها بعض اجناس الفطريات المسببة لامراض البياض الدقيقي , وتتكون في سلاسل تحمل على حامل كونيدي وتنفصل عند نضجها .
4. الجراثيم الكلاميدية Chlamydospores :
وتتكون هذه الانواع من بعض خلايا الخيوط الفطرية وتنشأ عنها جراثيم وحيدة الخلية ذات جدار سميك مقاوم للظروف البيئية غير الملائمة .
5. الجراثيم المتبرعمة Blastospores :
ويطلق هذا المصطلح على البراعم التي تنشأ من خلايا الخميرة .
وبالنسبة للجراثيم الجنسية Sexual spores والتي تكون في الغالب اقل انتشارا من الجراثيم اللاجنسية – لانها تتكون تحت ظروف محددة – فانه ايضا توجد منها عدة انواع :
1. الجراثيم الاسكية او (الزقية) Ascospores :
وهذه تتكون داخل اكياس تسمى الاكياس الاسكية Ascus وجمعها Asci , ويحتوي الكيس الواحد غالبا على ثماني جراثيم اسكية وحيدة الخلية .
2. الجراثيم البازيدية Basidiospores :
وهي جراثيم وحيدة الخلية تكون خارجية على زوائد ذات نهايات منتفخة تسمى بازيدات Basidia ومفردها Basidium .
3. الجراثيم الزيجية Zygospores :
وتتكون هذه الجراثيم نتيجة التحام نهايات خيطين فطريين متلائمين جنسيا
Sexually compatible وتنشأ عنهما جراثيم كبيرة الحجم ذات جدار سميك .
4. الجراثيم البيضية Oospores:
وتتكون هذه الجراثيم داخل تراكيب انبوبية انثوية خاصة تسمى Oogonium , ويتم اخصاب البويضة بواسطة عضو مذكر يسمى Anthidium , وقد يحتوي التركيب المعروف باسم عضو التانيث على جرثومة بيضية واحدة او اكثر .
ويلاحظ ان كلا من الجراثيم الجنسية واللاجنسية قد تكون في بعض الاحيان محاطة بتراكيب وقائية خاصة تسمى الاجسام الثمرية Fruiting bodies , وهذه الاجسام تاخذ اسماء مختلفة تبعا لنوع الفطرالذي يكونها .
ومع ان بعض انواع الفطريات تكون جراثيم جنسية ةلاجنسية , تحت ظروف بيئية مختلفة وبطرق متعددة , فان نوع الجراثيم وتركيبها يظل ثابتا , ويعتبر احد اهم الطرق المستعملة في تعريف الفطريات وتقسيمها .
الرئيسية 
